维根斯搅拌器其控温方式方法普遍有两种。一种是用电接点水银温度计控温，另一种是采用传感器(电热偶)控温。在使用过程中电接点水银和传感器一端都是要放入到测量的液体中，另一端与机器连接，在控温过程中，当液体温度低于设定温度，加热盘开始加热，当液体温度达到所设定的温度，这时由电接点水银温度计或传感器传输信号到磁力搅拌器主机，此时加热盘停止加热，当温度再次低于设定温度时，加热盘继续加热。
维根斯搅拌器需恒温加热时，将温度测量探头插入溶液中，并将插头插入搅拌器座上(对应于水浴集热式磁力搅拌器而言，因其温度测量探头是集成水浴锅内部，无此步骤)，调节温度旋钮至所需温度。若不需加热，只要把温度调节旋钮调至室温以下即可，需进行定时操作时，将定时开关顺时针旋至所需的时间位上，此时电源灯亮，仪器处于工作，当定时开关自动转到起始位时，搅拌自动停止。使用完毕关闭电源开关，将反应装拆卸，并拔掉磁力搅拌器电源插头。
维根斯搅拌器控温时要注意两点：
加热盘有热惯性，控温时有可能高于设定温度，如果实验要求比较高，此时要注意控制加热盘的温度(即加热电压)。
采用电接点水银温度计控温时是在电接点水银温度计上面设定温度，采用传感器控温方法是在机器主机上设定温度。由此看出，传感器控温更加方便。但是传感器采用金属材料，所以耐腐蚀程度没有电接点水银温度计玻璃的好。
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